وعلى أثر الاضطرابات التسعينية في أبريل تم اعتقاله لمدة خمسة أشهر.
اعتقل ابنه محمد جميل وزوج ابنته عبد الجليل وحكم عليهما بعشر سنوات وسبع سنوات سجنا على التوالي.
وقد أُطلق سراحه في يوليو بعد تولّي ملك البحرين ، إلا أنه ظلّ رهن الإقامة الجبرية بمنزله حتى.