يروى مصطفى محمود أنه عندما عرض على التلفزيون مشروع برنامج العلم والإيمان, وافق التلفزيون راصدًا 30 جنيه للحلقة! إلا أن المحكمة اكتفت بمصادرة الكتاب، بعد ذلك أبلغه الرئيس أنه معجب بالكتاب وقرر طبعه مرة أخرى!.
كما يرى البعض أنه غير متخصص في مجالات علوم الدين والفلسفة التي يؤلف فيها.
تعود شهرة المفكر الراحل إلى برنامجه العلم والإيمان، الذي قدم منه على شاشة التلفزيون المصري 400 حلقة، وأصبح أشهر البرامج التلفزيونية وأوسعها انتشارا وتوفي في تمام الساعة السابعة والنصف من صباح السبت 31 أكتوبر 2009 بعد رحلة علاج استمرت عدة شهور عن عمر ناهز 88 عاما.
تزوّج الدكتور مصطفى في عام 1961م، غير أنّ زواجه هذا انتهى بالطلاق في عام 1973م، وكان قد تزوّج مرة ثانية في العام 1983م من زينب حمدي، ولم يستمر هذا الزواج سوى خمس سنين حيث تم الطلاق في 1987م.
مصطفى محمود وهذا شأن المكاسب المادية، كلما ازدادت ازداد الافتقار إليها وإلى المزيد منها، وبالتالي ازدادت التعاسة.
كان إنطوائياً، حالماً و يعشق التفكير و السهو الطويل في كل مجالات الحياة منذ صغره و كان يرى أشخاص مثل: ، ، و كقُدوات له.